Base del Grande Mazinga, la Fortezza delle Scienze è comandata dal dottor Kabuto.
Dotata di potenti armi di attacco e di difesa, è in grado di generare una barriera di energia
per proteggersi dagli attacchi nemici ed inoltre può inabissarsi al comando del dottore, sempre a scopo difensivo.
Più volte danneggiata in battaglia, verrà sempre ricostruita dal personale per essere sempre pronta di fronte al nemico.
Grazie ad apposite rampe, dalla base vengono lanciati i componenti aggiuntivi per i robot.